SliverWorkspace


一个图形化声明式 I/O + shell 命令 + 变量插值的生物信息学分析 DAG 引擎

SliverWorkspace 2.7.844644 版本发布： 新增组件拖曳式报告设计器，支持常见12种图表、数据表格，完成流程设计、输入、输出功能闭环
  • 全新设计的登录页、全新的主题配色、软件通知、用户反馈等功能。
  • 样本输入数据表单设计器，将流程输入变量设计成表单
  • 向导模式增强：新增选择已有文件,轻松点击鼠标只需4步即可完成分析获取分析结果，文件上传支持断点续传。
  • 文件预览：分析输出文件tsv/csv/vcf/vcf.gz/bam/pdf及多种图片格式支持直接预览，可配合IGV Browser查看。
  • 专业的流程代码编辑器:变量输入输出提示，查找替换，全屏显示
  • 获取实时任务输出日志
  • 重新设计的文件管理器，大幅提高性能
  • 流程输入、输出支持文件通配符 * 和 ?
  • 分析输出文件网页、图片、PDF文档直接打开浏览无需下载
  • 基于Shell的图形化流程设计器,支持运行snakemake,nextflow,wdl脚本
  • 图形显示的实时流程运行控制与时间统计
  • 支持单台服务器到Torque/PBS、Slurm集群平滑升级与扩展
  • 分析结果数据库存储，海量数据储存备份
  • 多账户、多角色灵活配置、业务数据灵活授权，便捷的团队协作
  • 分析服务器节点性能监控（CPU、内存、IO、网络）及报警功能
SliverWorkspace 流程设计器界面
社区版下载 帮助文档 流程设计 输入表单 报告设计 向导模式 代码编辑 分析日志 更多内容
...

声明式 I/O + shell 命令 + 变量插值的 DAG 引擎

基于shell语法的变量${variable}插值引擎底座兼容snakemake,nextflow,wdl高层扩展
I/O 声明的深层语义 ：input/output 声明不仅是文件匹配，更是容器挂载边界——便于把本地目录按需挂载进 Docker 容器（如 ${data} 只读挂载、${result} 写入挂载），同时收窄任务对主机的读写范围、降低容器逃逸/误写主机的风险。这解释了设计器为什么强制节点先声明 I/O 再写命令：声明即白名单。

更多内容
...
...
...

实时监控分析过程，统计运行时间，灵活控制分析过程

运行时能够实时显示分析运行状态，统计运行时间；可随时控制停止分析过程，可以在流程停止或错误处恢复分析过程。

更多内容
...

从测序仪到最终获取分析结果/分析报告全自动完成

基于样本信息、服务器资源调度、灵活设计的分析流程基础上的全自动运行分析控制。7×24小时运行，节省人力，提供更高的效率与更低的成本。

更多内容
...